總結毛利小五郎的所有疑點，其實他早就發現了柯南的真實身分？

1.小五郎身手不凡，沒拿到柔道冠軍是因為有「比賽恐懼症」，並不是沒有實力。（見TV 26-27小五郎同學會殺人事件）,槍法在警局裡也是數一數二的。

2．在M9水平線上的陰謀那集，毛利比柯南更早發現了真兇．平時不在意的他看到與妻子長相相似的凶手就顯出本色了。

3．毛利對柯南態度一直都很差，但似乎柯南從沒有得罪過他，最可能的原因是他知道柯南就是那個讓小蘭傷心的高中生工藤新一。基於父愛，那樣的表現是很正常的。

4．柯南雖然是虛構的，但青山不至於讓一個人莫名其妙暈倒和破案多次而不發覺，更合理的解釋應該是毛利是在刻意為柯南掩飾。

5．像妃英理這樣的人絕對不會喜歡上並且嫁給一個平庸幾近白痴的人。（這是很重要的一點。）

6．柯南里的人物名字都是拼出來的。毛利是從亞瑟/羅賓的作者盧布郎得來的，小五郎是江戶川亂步塑造的偵探明智的名字。由此看來，毛利在青山剛昌心目裡肯定是個很優秀的偵探。

7．雖然柯南講的大部分是高中生偵探如何如何優秀，但青山把父輩們寫的更勝一籌。服部平藏曾經成功地利用了平次，而後者並沒有立刻發覺（TV263大阪雙重謎團），在有關一個遺產的案子裡工藤優作也早於柯南發現了真相。據此看來，毛利也差不到哪去

8．只要只有柯南和小五郎兩個人時，小五郎對柯南的態度就大轉變，像是一起破案的夥伴。而每次柯南如果很認真地來和小五郎說他發現了什麼，小五郎都會相信。

9．TV38當中大叔曾經說過，每當我推理遇到瓶頸的時候，這個小子的一句話總是給我很大的啟示。這傢伙絕對不是等閒之輩，他到底是什麼來頭？

10．很多集，大叔被打針後都會說一些話，比如：「啊！我要開始了」或者「啊！沉睡的小五郎出現了」還有如「你還真狠心呢！好歹讓我先喝一口吧」又或者是「又來了，怎麼這麼突然呢！好歹先打聲招呼啊」「從另一個地方傳來我的聲音之後，我的脖子就會像針紮了一樣」（所以，推理大叔極有可能知道他被麻醉甚至知道被柯南君麻醉，而且只要旁邊有椅子，就一定會坐在椅子上，應該是故意的）

11. 每次小五郎被打針後蹲坐在那裡時，低著頭，表情總是皺著眉，好像真的在推理。

12. 柯南曾當著毛利大叔的面發射過麻醉針。(詳見《離別美酒殺人事件》)

13.在柯南（新一）幫助之前，小五郎都是自己解決案件的且還能一人養活蘭10年之久，可見他還是有很強的偵探能力的。

14.在漫畫書第二本裡，毛利小五郎是第一個發現柯南長的像新一的人。大叔當時說「等等，你的臉好像在哪裡見過……」之後被委託人打斷！